ФК Металург е основан през 1957 г. чрез сливането на два местни отбора, Строител и Торпедо. Отборът най-накрая става известен като Металург през 1963 г. Клубът обикновено се движи между Втора и Четвърта дивизия на българската футболна пирамида, с изключение на 2 сезона. През 1997/1998 те завършват на 11-то място и изпадат през сезон 1998/1999. Клубът беше възстановен през 2013 г., след като беше разпуснат през 2008 г. и започна от 4-та лига.  

Техен традиционен съперник е другият местен клуб Миньор Перник.